Naujas pandemijos etapas: pavojinga padermė „Delta“

2024 Autorius: Seth Attwood | [email protected]. Paskutinį kartą keistas: 2023-12-16 16:11

Naujoji Indijos atmaina COVID-19, kurią mokslininkai jau pavadino „Delta“, daugelyje šalių sukėlė trečiąją pandemijos bangą. Pačiame Naujajame Delyje padėtis tiesiog katastrofiška – 30 000 atvejų per dieną. Institutai ėmė studijuoti „Deltą“ir tuoj pat įjungė pavojaus signalą.

Naujoji padermė pasirodė ne tik labiau užkrečiama, bet ir mažiau pažeidžiama antikūnų. Tai reiškia, kad jis gali sėkmingai atsispirti „kontratakoms“, kurias prieš jį sukels mūsų imuninė sistema.

Kai 2020 m. gruodį Indijos Maharaštros valstijoje pirmą kartą pasirodė koronaviruso variantas, dabar pramintas „Delta“, tai neatrodė nieko ypatingo. Tačiau kai po kelių mėnesių tai pasiekė Naująjį Delį, pasekmės buvo labiausiai pražūtingos – balandžio pabaigoje kasdien buvo užfiksuota beveik 30 000 atvejų. „Staiga jis pradėjo dominuoti ir visiškai sutriuškino alfa padermę, kuri iki tol buvo labiausiai paplitusi mieste“, – sako Anurag Agrawal, Genomo ir integracinės biologijos instituto Naujajame Delyje vadovas.

Panašu, kad Naujasis Delis nesusidurs su kitu dideliu protrūkiu, sakė Agrawal, nes daugelis jo gyventojų sirgo arba buvo paskiepyti. Tačiau paaiškėjo, kad šios gynybos priemonės nuo Deltos yra bejėgės. Jis labiau užkrečiamas ir pabėga nuo imuninės sistemos, sako jis: „Trijų metrų siena aplink miestą tarsi virto pusmetrine, per kurią nesunku peržengti“.

Iš Naujojo Delio ši įtampa sparčiai išplito ir dabar atrodo, kad pasaulį užlieja nauja niokojanti banga. JK Delta jau sudaro daugiau nei 90% naujų atvejų: dėl to koronaviruso atvejų skaičius vėl šoktelėjo po staigaus sumažėjimo, o praėjusią savaitę vyriausybei netgi teko atidėti paskutinį savo sienų atvėrimo plano etapą.. Deltos protrūkis Lisabonoje privertė Portugalijos vyriausybę įvesti trijų dienų draudimą keliauti tarp sostinės ir likusios šalies dalies.

Iki rugpjūčio pabaigos ši galimybė sudarys iki 90% visų koronaviruso atvejų Europos Sąjungoje, šiandien perspėjo Europos ligų prevencijos ir kontrolės centro vadovė Andrea Ammon. „Labai tikėtina, kad Delta atmaina vasarą plačiai išplis, ypač tarp jaunų žmonių, kurie nedalyvauja vakcinacijos programoje“, – sakė ji. „Tai gali kelti pavojų labiau pažeidžiamiems piliečiams sunkiai susirgti ar net mirti. jei jie nėra visiškai paskiepyti“.

Delta lenktynės buvo užfiksuotos Rusijoje, Indonezijoje ir daugelyje kitų šalių. JAV, kur šios padermės paplitimas yra mažiausiai 14 proc., CDC birželio 15 d. pareiškė, kad tai „kelia didžiausią susirūpinimą“.

Šis pakilimas paskatino daugybę tyrimų, siekiant suprasti, kodėl Delta plinta daug greičiau nei kiti trys nerimą keliantys variantai, jei kitaip ji yra pavojingesnė, ir kaip jos unikalus mutacijų rinkinys, sukeliantis baltymų aplinkos pokyčius, gali sukelti rimtą žalą. Delta atėjimas pabrėžė, kad SARS-CoV-2 virusas gali prisitaikyti ir vystytis per ateinančius mėnesius ir metus.

Šiuo metu Delta kelia ypatingą grėsmę skurdžiausioms šalims, kurių galimybės gauti vakcinas yra ribotos arba jų visai nėra, sako Sumya Shwaminathan, Pasaulio sveikatos organizacijos vyriausioji mokslinė patarėja. „Mane labiausiai neramina tai, kas bus, kai Delta pateks į Afriką“, – sako ji.

Anglijos visuomenės sveikatos tyrimas atskleidė Delta platinimo potencialą. Palyginti su Alpha, kuri JK buvo pristatyta 2020 m., „mes turime 50 % arba 100 % daugiau perdavimo atvejų“, – sako Adamas Kucharskis, Londono higienos ir atogrąžų medicinos mokyklos modelių kūrėjas.

Tačiau Kuharsky taip pat sako, kad sumažėjusi apsauga nuo vakcinų galėjo turėti įtakos. Remiantis Anglijos ir Škotijos duomenimis, Pfizer-BioNTech ir AstraZeneca vakcinos suteikia šiek tiek mažesnę apsaugą nuo simptominių infekcijų naudojant naująjį variantą nei Alpha štamo vakcinos. Žmonės, patyrę tik vieną šūvį, yra ypač pažeidžiami – kaip ir daugelis JK. (Dvi bet kurios vakcinos dozės užtikrins tokį patį aukštą apsaugos lygį nuo hospitalizavimo, net ir nuo Delta.) Kaip gerai apsaugo kitos visame pasaulyje naudojamos vakcinos, neaišku, ir yra mažai įrodymų apie apsaugą tiems, kurie pasveiko po ankstesnių koronaviruso bangų.

Abu šiuos efektus – padidėjusį perdavimą ir imuniteto vengimą – sunku atskirti vienas nuo kito, tačiau „Wellcome Trust“vadovas Jeremy Farrar mano, kad perdavimas yra už Delta šuolio, o ne imuniteto apėjimo. „Jei Alfa yra apie 50 % labiau užkrečiama nei natūrali padermė, o Delta – dar 50 %, tai mes kalbame apie virusą, kuris yra dvigubai labiau užkrečiamas nei pirminė padermė“, – aiškina evoliucinis virusologas iš Oksfordo Aris Katzourakis universiteto.

Tai reikš, kad šalys ir populiacijos, kuriose skiepijama mažai, gali susidurti su dideliais naujais protrūkiais. „Jei greitesnis plitimas yra visiškai dėl viruso priežasčių, tai yra pražūtinga žinia visam likusiam pasauliui“, – sako Kuharskis.

Be to, „Delta“labiau tikėtina, kad neskiepytus piliečius siųs į ligoninę nei „Alfa“. Pirmieji JK duomenys rodo, kad hospitalizavimo rizika gali būti dvigubai didesnė. Kartu šios savybės gali sukelti didelių problemų Afrikoje, sakė Schwaminathanas. „Nebus deguonies, neužteks ligoninių lovų. Ir mes jau žinome, kad ligoninių rezultatai Afrikoje yra prastesni nei kitose šalyse, sako ji. "Taigi tai tikrai gali sukelti didesnį mirtingumą net tarp jaunų žmonių."

Mutacijos trukdo antikūnams

Mokslininkai ką tik pradėjo aiškintis, kodėl Delta yra tokia pavojinga. Jie sutelkė dėmesį į devynių mutacijų rinkinį geno, koduojančio smaigalio baltymą, kuris zonduoja paviršių ir leidžia virusui patekti į žmogaus ląsteles. Viena svarbi mutacija, pavadinta P681R, pakeičia aminorūgštį, esančią šalia furino skilimo vietos, kur žmogaus fermentas skaido baltymą – tai pagrindinis žingsnis, leidžiantis virusui patekti į žmogaus ląsteles.

Alfa kamiene dėl šios mutacijos skilimas tapo efektyvesnis. Remiantis viena preliminariu leidiniu gegužės pabaigoje, dėl deltos mutacijų furinas suyra dar lengviau. Tyrėjai spėja, kad tai taip pat gali padidinti viruso pernešamumą.

Tačiau japonų mokslininkai, sukūrę tą pačią mutaciją turinčius pseudovirusus, nepatvirtino padidėjusio užkrečiamumo laboratorinėmis sąlygomis, o Indijoje kiti koronaviruso variantai su ta pačia mutacija pasirodė esą daug mažiau užkrečiami nei Delta, sako universiteto evoliucijos virusologas. Edinburgo, Andrew Rambaut). "Taigi genome turi būti sąveika su kažkuo kitu."

Kitos Delta mutacijos gali padėti susilpninti imunitetą. Kai kurie iš jų pakeičia stuburo N-galinį domeną (NTD), kuris išsikiša iš baltymo paviršiaus. Neseniai žurnale „Cell“paskelbtame straipsnyje buvo atskleista, kad viena iš NTD dėmių, pavadinta „super vieta“, visada nukreipta į „ypač stiprius“neutralizuojančius antikūnus iš pasveikusių pacientų. Unikalios Delta mutacijos pašalina aminorūgštis 156 ir 157 „viršdažnio“padėtyse ir pakeičia 158 aminorūgštį iš arginino į gliciną – pastarasis pašalina tiesioginį antikūnų surišimo tašką, aiškina Floridos universiteto struktūrinis biologas Davidas Ostrovas.

„Manome, kad 157/158 mutacija yra viena iš išskirtinių Delta mutacijų, suteikusių padermei šį imuniteto vengimo fenotipą“, – sutinka Trevoras Bedfordas, kompiuterinis biologas iš Fredo Hutchinsono vėžio tyrimų centro.

Kita NTD superregiono mutacija taip pat gali kovoti su antikūnais. Ir mokslininkai turėtų pradėti tirti kitų Delta baltymų pokyčių vaidmenį, sako Nevanas Kroganas, molekulinis biologas iš Kalifornijos universiteto San Franciske. „Daug ko nežinome apie šias galimybes visais lygmenimis. Atrodo, klaidžiojame tamsoje“. Pavyzdžiui, „Delta“turi keletą mutacijų nukleokapsidės baltyme, kuris atlieka daugybę funkcijų „kaip Šveicarijos armijos peilis“, – aiškina virusologas Davidas Baueris iš Franciso Cricko instituto. Tačiau norint išsiaiškinti, prireiks mėnesių eksperimentų.

Pagreitinta vakcinacija

Tuo tarpu mokslininkai sutaria: reikia imtis skubių veiksmų siekiant sustabdyti naujojo varianto plitimą. „Delta susirūpinimas turėtų paskatinti mus tikrai paspartinti skiepijimą ir padidinti vakcinų prieinamumą toje srityje, kurioje Delta vis labiau populiarėja“, – sakė virusologė Angela Rasmussen iš Saskačevano universiteto. JAV prezidentas Joe Bidenas paragino amerikiečius pasiskiepyti, kad apsisaugotų nuo Delta. Ammonas šiandien paragino Europos šalis paspartinti planus visiškai paskiepyti pažeidžiamas populiacijas.

Be to, anot jos, būtina išlaikyti apribojimus, kad naujoji galimybė neišplistų ir nesukeltų naujo sergamumo, hospitalizacijų ir mirčių antplūdžio. Šalys, turinčios ribotą prieigą prie vakcinų, turi grįžti prie tokių priemonių kaip fizinis atstumas ir kaukės, sakė Rasmussenas. O Europoje Ammonas paragino šalis daryti abu: išlaikyti apribojimus ir stengtis visiškai paskiepyti pažeidžiamas populiacijas.

Tikslas yra ne tik išgelbėti gyvybes, bet ir užkirsti kelią tolesniam viruso vystymuisi. Delta plitimas parodė, kad mokslininkai negali laiku atpažinti pavojingų naujų variantų, kad sustabdytų jų plitimą, teigia Bazelio universiteto virusologė Emma Hodcroft, nepaisant precedento neturinčių pasaulinių pastangų stebėti jų raidą realiu laiku. Būtų pavojinga manyti, kad SARS-CoV-2 ten sustos, sakė Katsurakis. „Viskas, kas evoliucijoje įvyko bent du kartus, jau yra modelis“, – sako jis. – Nenustebčiau, jei per ateinančius metus ar dvejus pamatysime panašius pokyčius.